Le projet AFUE3 est divisé en 2 phases. La première phase commencera fin 2011 / début 2012 et durera 3 ans. Cette phase a nécessité le lancement de différents appels à contribution (AAC). Ceux-ci ont permis la sélection de partenaires. Si le projet est retenu par le ministère du développement durable, les partenaires choisis seront considérés comme des membres à part entière du projet et les travaux qu’ils proposent seront financés en partie, selon les règles des investissements d’avenir.
Tous les appels sont désormais clôturés.